目前醫學界對於自閉症的成因尚未取得共識，但可以排除並非心理因素造成，另外還有以下幾種可能的原因：
✔基因遺傳
美國研究發現，有83%的自閉症和基因相關。家族中同父母的兄弟姊妹已有自閉症患兒，或本身體質帶有變異染色體，如罹患X染色體易脆症，都有可能受到影響。
✔病毒感染
孕婦在懷孕期間感染德國麻疹、流行性感冒等病毒，或嬰幼兒時期感染到腦膜炎等等，也可能造成胎兒腦部受損，使其發育不全，增加得到自閉症的機會。
✔胎兒腦損傷
如果孕婦在懷孕過程服用特定藥物、營養不良，或是早產、難產等因素，都有可能讓胎兒大腦發育不全，增加自閉症的發生。
✔新陳代謝失調
如果孩童體內有新陳代謝異常，就有可能影響腦細胞、腦神經傳遞功能，進而增加罹患自閉症的機率。
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